Nuevos biomarcadores moleculares para la detección del cáncer de pulmón: una aproximación desde la oncogenómica funcional

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Nuevos biomarcadores moleculares para la detección del cáncer de pulmón: una aproximación desde la oncogenómica funcional

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Disponibilidad: Disponible


Categoría: Medicina

Editorial: Universidad Nacional de Colombia

Universidad Nacional de Colombia

Año de Edición: 2013

2013

ISBN: 9789587616590

9789587616590

Sede: Bogotá


En las últimas dos décadas, el avance en el conocimiento de la biología del cáncer ha llevado a la identificación de circuitos moleculares diferenciales en tumores sólidos. Estos reflejan alteraciones en vías de señalización específicas que podrían estar involucradas en la progresión mal...
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SKU: 231346

Producto creado el 17/01/2014

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Detalles

En las últimas dos décadas, el avance en el conocimiento de la biología del cáncer ha llevado a la identificación de circuitos moleculares diferenciales en tumores sólidos. Estos reflejan alteraciones en vías de señalización específicas que podrían estar involucradas en la progresión maligna. El conocimiento de estas alteraciones ha generado un gran panel de posibles biomarcadores que requieren ser probados y validados para ser utilizados en el entorno clínico. En este capítulo se describe un abordaje bioinformático de análisis transcriptómico “metasignature” obtenido a partir de 40 estudios de expresión génica en muestras clínicas de cáncer de pulmón (CP) disponibles en las bases de datos en línea GeneSigDB y MolSigDB, en un esfuerzo por identificar genes como potenciales biomarcadores.

Los datos generados evidenciaron un grupo de 34 genes que podrían ser utilizados para discriminar entre fenotipo tumoral y normal (p<0.01), según el grupo de datos “dataset” de Bittner, y para diferenciar entre los tipos histopatológicos de CP, según el grupo de datos de Takeuchi y col., 2006 (1). Además, el metasignature es capaz de discriminar los adenocarcinomas pulmonares de buen y mal pronóstico (p=0,028) y un subconjunto de 13 genes del metasignature asociados con buen pronóstico de sobrevida (p=0,0037). Se identificaron tres módulos funcionales significativamente afectados en el metasignature, relacionados con alteraciones en el ciclo celular, remodelación de la matriz extracelular, procesos metabólicos, transducción de señales y reparación del ADN.
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Información adicional

Editor / Marca Universidad Nacional de Colombia
Ciudad Bogotá
Facultad Vicerrectoría General
Idioma(s) Español
Tipo Producto libro
Uflip URL http://www.uneditorial.net/uflip/Nuevos_Biomarcadores_Moleculares/
custom_attributes_author~Autor~pv

Sandra Perdomo, Matias Butti, Martin Abba, Fabio Aristizábal

información no disponible.

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Resumen

Búsqueda de marcadores moleculares para la detección de cáncer de pulmón: análisis bioinformático de 40 perfiles de expresión génica

Marco conceptual
La bioinformática y el descubrimiento de biomarcadores de cáncer
SIGNATURE: análisis de la expresión génica

Materiales y métodos
Identificación de características comunes de expresión en las “firmas moleculares” de cáncer de pulmón
Extracción de los datos y agrupación jerárquica
Análisis de minería de datos
Expresión génica metasignature y análisis de supervivencia

Resultados y discusión
Identificación del metasignature de expresión génica y análisis de minería de datos
Vías de señalización biológicas enriquecidas (Kegg)
Módulos de expresión génica asociados con el metasignature
Regulación de la transición G1/S del ciclo celular “E2F3”
Regulación del punto de control del huso mitótico MAD2L1, BUB1B y CENP-A
Proteínas del complejo Polycomb y cáncer de pulmón
Significado clínico de ciclina B1 (CCNB1), ciclina B2 (CCNB2), ciclina A2 (CCNA2) y WEE en cáncer de pulmón
Relevancia pronóstica de la expresión de PCNA en cáncer de pulmón
Topoisomerasa II (TOPA2) y resistencia en cáncer de pulmón

Familia de proteínas Ras GTPasas
Influencia del gen transformante de tumores de pituitaria PPTG1 en cáncer de pulmón
Familia de genes MYC y cáncer de pulmón
Fosfoglicerato quinasa (PGK1) y cáncer de pulmón

Genes de reparación (MSH6, PCNA y RFC4)
Reparación del ADN y CP

Módulo de proteínas de matriz extracelular y metabolismo celular
Relevancia de las citoqueratinas y TTF-1 (NKX2-1) en cáncer de pulmón
Colágeno en CP
Proteína surfactante C (PS-C) para la detección de CP en sangre periférica
Cáncer de pulmón invasivo y expresión de la molécula de adhesión 1 (ICAM-1)
Expresión diferencial de la enzima superóxido dismutasa (SOD2) en cáncer de pulmón
Aldehído deshidrogenasa (ALDH1A1) y CP

Ontología
Ontología GO: procesos biológicos
Ontología GO: componente celular
Ontología GO: función molecular

Conclusiones
Referencias bibliográficas

Anexos
Vías de señalización biológicas enriquecidas en el metasignature

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